尼希米記的開始，便描寫在波斯王宮任酒政的尼希米，² 因聽見耶路撒冷城牆毀壞的消息，遂禱告了四個月，才找機會求亞達薛西王准許他回國。得到波斯王的任命和詔書，回國修築城牆本應是件易事。但回國後，尼希米發現情況並非如他所想像，內外都充滿困難。然而，困難沒有使他氣餒，反而激起他和其他人的決心，最終整件工程在五十二天內完成（尼六15~16）。

尼希米記七至十二章，集中在重建回歸的猶太人身上。由一份名單開始（七章），這可能是參與建造的人。經過宣讀上帝的話，百姓知罪悔改，重新與上帝立約，並掣籤，每十人中使一人來住在耶路撒冷（參十一至十二章的名單）。最後是奉獻城牆禮，民眾分為兩隊，在利未人帶領下，從不同之處登上城牆，聚集在一起，然後歡欣踏步下城牆，回到聖殿。這奉獻禮不但是全書的高潮，也是這群人的新開始。 可惜，尼希米記十三章就出現「反高潮」。尼希米任省長十二年後，回波斯述職。回來時，他發現聖殿被佔用，有人與異族通婚。因此，他迫不得已再進行一次「靈命清潔運動」。

與以斯拉記一樣，尼希米記展述回歸的猶太人重建的計劃。這重建包括四方面，與延續他們的民族有莫大關連：

（A）重建聖殿：延續民族的中心（聖地）。
（B）重建血統：延續民族的命脈（聖民）。
（C）重建城牆：延續民族的保障（聖城）。
（D）重建靈命：延續民族的意志（聖訓）。

尼希米記重建城牆，實際上，是重新建立其國家形象。首先，耶路撒冷是舊都，雖然國家仍受制於外敵，但有了一個完整的中心點，起碼可作招聚以色列人的地標。這與重建聖殿有相同的意義，只不過聖殿是在屬靈層面上作標記，而聖城就在屬世層面上作標記。況且，在面積上，聖城比聖殿大。再者，建好城牆後，尼希米就鼓勵百姓從各地遷回耶路撒冷居住，這對重建聖城又是很重要的一步。